Depuis leur fondation, les CUK ont toujours eu une triple mission : la dispensation des soins de haute qualité, de l’enseignement pratique de médecine destiné aussi bien aux étudiants de la Faculté de Médecine qu’aux élèves d’écoles d’infirmières et aux autres paramédicaux, et, enfin, celle de la recherche scientifique.
Dans la structure actuelle de la stratification des soins de santé en République Démocratique du Congo (RDC), les CUK sont classées dans l’échelon le plus élevé ayant le rang de l’Hôpital tertiaire de dernière référence pour le pays.
Depuis l’époque de l’Université Lovanium, les CUK, dans l’accomplissement de leur mission, ont toujours collaboré avec les autres institutions universitaires à travers le monde, notamment celles de la Belgique, du Canada, de l’Allemagne, de la France et des autres pays africains. Avec les Universités Belges, il s’agissait principalement d’échange d’étudiants stagiaires.